HPSee는 고성능 컴퓨팅 및 가상 스크리닝을 위한 확장 가능한 워크플로우 환경입니다. 단백질 구조 기반의 가상 스크리닝과 같은 대규모 계산을 쉽게 할 수 있도록 개발되었습니다.
BioSolveIT 애플리케이션에서 간단한 설정 후 사용자는 HPSee를 운용하는 고성능의 하드웨어로 계산을 실행할 수 있습니다. 사용자는 계산이 끝나면 추가 작업을 위해 편리하게 결과에 접근할 수 있습니다. 복잡한 라이브러리 및 데이터의 사전 작업이 필요하지 않습니다.
깔끔한 관리 대시보드는 직관적인 인터페이스로 되어 있습니다. 관리자는 플랫폼을 운용하면서 화합물 라이브러리, 화합물 스페이스 (Chemical Space) 및 사용자 권한을 쉽게 관리할 수 있습니다.
HPSee는 SeeSAR 13.1 버전부터 원격 도킹 모드와 결합되어 있습니다. HPSee는 구조 기반 (Structure-based) 대규모 가상 스크리닝 (Large Scacle Virtual Screening)을 지원합니다. 분자 구조 라이브러리를 HPSee에 업로드 할 수 있으며, 사용자는 원격 도킹 모드에서 업로드된 라이브러리를 선택할 수 있습니다. 계산을 실행하면, HPSee는 HYDE를 사용하여 표적-리간드 복합체 (Protein-Ligand Complex)의 결합 포즈 생성 및 스코어링을 수행합니다. HPSee의 마지막 단계는, SeeSAR에서 시각적으로 결과를 확인할 수 있도록 합니다.
HPSee는 화합물 스페이스 도킹 (Chemical Space Docking)이 - BioSolveIT 신규의 구조 기반 가상 스크리닝 (Structure-Based Virtual Screening) 방법 - 용이하도록 개발되었습니다. HPSee를 사용하면 가장 유망한 화합물을 찾기 위해 수십 억 또는 조 단위의 화합물 스페이스를 편리하고 효율적으로 스크리닝 할 수 있습니다. HPSee는 BioSolveIT의 일상적 신약 탐색 대시보드인 SeeSAR와 결합하여 구조 기반 약물 탐색 프로젝트를 강화할 것 입니다. 초보 연구자도 화합물 스페이스 도킹 워크플로우를 손 쉽게 실행하고 결과를 확인할 수 있습니다.