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infiniSee는 합성 가능한 화합물로 구성된 세계를 탐색할 수 있는 화합물 스페이스 내비게이션 플랫폼입니다.
infiniSee는 최첨단 기술을 사용하여 조 단위가 넘는 화합물 컬렉션에 대해 관련성 있는 화학 구조를 채굴함으로써 저분자 약물 탐색의 초기 단계를 위한 사냥터를 획기적으로 확장합니다. 각각의 모드에서는 최상의 후보들을 선별하기 위하여 프로젝트의 요구에 따라 분자를 검색합니다. 일반적인 접근 방식으로는 조 단위 엔트리의 항목을 처리하는데 많은 시간이 필요하지만, infiniSee는 구매 가능한 주문형 화합물과 새로운 IP (Intellectual Property)의 결과를 몇 초 안에 제공합니다.
주문형 화합물 검색
주문형 화합물 검색
infiniSee의 다양한 검색 방식은 화합물 스페이스로부터 약물 탐색 도전 과제에 알맞은 화학 구조를 제공합니다.
Scaffold Hopper (FTrees)는 쿼리 구조에 대해 약리단 (Pharmacophore)을 유지하면서 신규성과 IP 잠재력이 높은 분자구조를 제공합니다.
Analog Hunter (SpaceLight)로 쿼리 구조에 가까운 화합물을 화합물 스페이스에서 조사하는 것은, 개선된 ADME 특성을 갖는 시리즈 내에서 SAR 및 분자 변형을 설명하는데 도움을 줄 수 있습니다.
Motif Matcher (SpaceMACS)는 두 가지 방식이 있습니다. 첫 번째는 쿼리 구조의 Maximum Common Substructure (MCS)를 공유하는 화합물을 제공합니다. 두 번째는 쿼리에서 관심 있는 특정 하위 구조 (Substructure)를 활용하여, 이 부분의 정확한 하위 구조 (Exact Substructure)를 내포하는 분자 구조를 찾는 것 입니다. 이는 단편 구조 기반 약물 탐색 (Fragment-Based Drug Discovery, FBDD)의 기회를 열어 줍니다.
궁극적으로 연구에 무엇이 중요한지 결정한 다음 가장 관련성이 높은 구조들을 추출하기 위하여 다양한 매개 변수와 제약 조건을 적용하고 검색을 세분화 합니다.
주문형 화합물 벤더
주문형 화합물 벤더
REAL Space by Enamine
AMBrosia by Ambinter
CHEMriya by OTAVAchemicals
eXplore by eMolecules
Freedom Space by Chemspace
GalaXi by WuXi LabNetwork
CoLibri - 화합물 스페이스 생성
CoLibri - 화합물 스페이스 생성
때로는 자신만의 화합물 라이브러리를 만드는 것이 완벽한 솔루션입니다. 회사 내에 축적되어 있는 지식과 자원으로 화합물 스페이스를 디자인 할 수 있습니다. 화학 반응들 (Reactions)과 빌딩 블록 (Building Blocks)을 정하여 엄청난 수의 가상 화합물을 생성할 수 있습니다. 여러 대형 제약 회사들은, Scaffold 대체 구조를 비용과 시간을 절약하여 찾기 위해, 자신만의 화합물 스페이스를 구축하였습니다. 합성이 가능하다는 것은 거의 모든 제약 연구에서 중요한 열쇠입니다. CoLibri는 합성 노하우를 화합물 스페이스로 - 즉, 합성적으로 접근 가능한 가상 화합물 라이브러리로 - 변환하는 도구입니다.
ADME 예측 - Optibrium
ADME 예측 - Optibrium
물리화학적 특성들 (Physicochemical properties)은 유망한 후보 약물이 될 수 있는지 판단하는데 있어 중요한 요소입니다. 약물 탐색 초기 단계에서 ADME 특성 평가는, 독성 이슈 및 흡수 (Absorption) 문제를 예측하여 시간과 자원을 절약할 수 있습니다. SeeSAR에서는 LE (Ligand Efficiency), LogP, TPSA (Topological Polar Surface Area) 등을 계산할 수 있으며, Optibrium의 StarDrop 옵션 모듈을 통해 CYP, BBB (Blood Brain Barrier to Blood Distribution), 용해도 (Solubility), hERG 등의 ADME 특성을 예측할 수 있습니다.
분석 - 화합물 클러스터링
분석 - 화합물 클러스터링
infiniSee의 분석 모드에서는, 화합물을 관리하고 데이터에 대한 통찰을 얻을 수 있습니다. Bemis-Murcko Scaffolds 및 골격 (Skeletons)을 기반으로 화합물을 클러스터링 (Clustering) 한 다음, 각 그룹을 살펴보고 가장 유망한 후보를 고를 수 있습니다. Drug-like, fragment-like, lead-like를 포함한 다양한 필터링 기능으로 화학적 다양성이 있는 구조를 선택할 수 있습니다. 검색 화합물과 관련된 빌딩 블록 (Building Blocks) 및 시약 (Reagents) 구조를 확인할 수 있으며, 화합물 공급 업체 별로 분류하여 Name 정보로 간편하게 견적을 받을 수 있습니다.
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